جمعی از دانشجویان این دانشگاه از مشکلات فاجعه بار این دانشگاه خبر دادند و به شدت از مسئولان وزارت علوم به خاطر عدم نظارت بر این دانشگاه گلایه کردند. خبرنامه دانشجویان نوشت:به خاطر مختلط بودن سلف دانشگاه محمدیه قزوین بسیاری از دانشجویان دختر نمی توانند به آن مراجعه کنند و این مسئله مشکلات زیادی را برای این دانشجویان به وجود آورده است.یکی از مسئولان بلندمرتبه دانشگاه خطاب به دانشجویان معترض گفته است به خاطر جذب دانشجو نمی توانیم با این فضا برخورد کنیم!